Марат Хуснутдинов родился в селе Асекеево Асекеевского района Оренбургской области.

В 1959 году окончил Куйбышевский инженерно-строительный институт (КуИСИ), в 1968 году – аспирантуру КуИСИ, в 1976 году – Академию народного хозяйства СССР. Марат Хайрутдинович – кандидат технических наук (1987), академик Международной академии корпоративного управления (1997), академик Российской академии технологичеcких наук (1998).

Трудовую деятельность начал в 1959-1962 годах бригадиром бетонщиков, мастером, прорабом СМУ-13 (г. Набережные Челны), главным инженером СМУ-36 треста «Татспецстрой» (г. Бугульма).

В 1962 году возглавил строительно-монтажное управление № 38 треста «Татспецстрой» (р. п. Карабаш).

В 1964-1969 годах трудился главным инженером треста «Татспецстрой» (г. Альметьевск).

В 1969 году становится главным инженером, а затем и начальником объединения «Татнефтестрой» (г. Альметьевск).

В 1972-1986 годах Марат Хайрутдинович трудился заместителем министра строительства предприятий нефтяной и газовой промышленности СССР (г. Москва), в 1986-1990 годах — советником министра газовой промышленности Республики Куба (г. Гавана), в 1990-1992 годах — директором Центра «Союзнефтегазстройтруд» (г. Москва), в 1992-1993 годах — начальником Главного управления межгосударственных и межрегиональных отношений Министерства топлива и энергетики Российской Федерации (г. Москва), в 1993-94 годах — заместителем председателя Государственного комитета Российской Федерации по экономическому сотрудничеству с государствами — членами СНГ (г. Москва), в 1994-2000 годах — заместителем министра Российской Федерации по делам СНГ (г. Москва).

Марат Хайрутдинович имеет множество наград. Среди них: ордена «Знак Почета» (1966), Трудового Красного Знамени (1971, 1978); медали «3а доблестный труд» (1970), «Ветеран труда» (1991), «В память 850-летия Москвы» (1997), «За строительство магистрального газопровода «Союз» (1979), «В ознаменование добычи трехмиллиардной тонны нефти Татарстана» (2007). Он является Почетным работником газовой промышленности, Почетным работником Миннефтегазстроя, заслуженным работником Минтопэнерго Российской Федерации, Почетным работником транспорта, Почетным работником топливно-энергетического комплекса, лауреатом премии им. академика И.М. Губкина.